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TATA盒標(biāo)準(zhǔn)序列解析:Pribnow盒序列與TATAAT序列詳解

文章核心:討論真核生物轉(zhuǎn)錄起始前的-25bp區(qū)段的TATA序列,即TATA盒,它是啟動(dòng)子的核心序列。

原文概述:

在真核生物轉(zhuǎn)錄起始前,TATA盒位于-25bp區(qū)段,是啟動(dòng)子的核心部分。啟動(dòng)子包括轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)以及調(diào)控轉(zhuǎn)錄的組件。在轉(zhuǎn)錄開(kāi)始前,多種轉(zhuǎn)錄因子與DNA的TATA盒結(jié)合,形成轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物,并開(kāi)始轉(zhuǎn)錄。而原核基因表達(dá)調(diào)控包括乳糖操縱子的調(diào)節(jié)基因等。某些DNA序列與特異蛋白因子結(jié)合時(shí),會(huì)對(duì)基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生阻遏作用,稱為負(fù)性順序調(diào)節(jié)元件。增強(qiáng)子是遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、能增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列。

詳解:

TATA盒或Goldberg-Hogness框的共有序列是TATAAAA。它通常位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-25~-30bp(真核生物)或-10(原核生物)的位置,控制轉(zhuǎn)錄的準(zhǔn)確性和頻率。除此之外,GC盒和CAAT盒也是常見(jiàn)的基因組件,它們位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游的特定區(qū)域。由TATA盒及轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)即可構(gòu)成最簡(jiǎn)單的啟動(dòng)子。

TATA盒的功能與RNA聚合酶的定位緊密相關(guān)。在DNA雙鏈揭開(kāi)并決定轉(zhuǎn)錄的起始位置的過(guò)程中,除去TATA框后,轉(zhuǎn)錄將在許多位點(diǎn)上開(kāi)始。作用于基本啟動(dòng)子上的輔助因子稱為通用轉(zhuǎn)錄因子(GTF)或基本轉(zhuǎn)錄因子,它們對(duì)于任何細(xì)胞類(lèi)別Ⅱ啟動(dòng)子起始轉(zhuǎn)錄都是必需的。最先結(jié)合到TATA框的因子是TFⅡD,它是一種寡聚蛋白,包含TATA結(jié)合蛋白和多種TBP聯(lián)結(jié)因子。這些因子有助于DNA的彎曲和打開(kāi),從而促使轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行。

通常認(rèn)為,TATA盒是啟動(dòng)子的核心序列。在轉(zhuǎn)錄起始前,幾種轉(zhuǎn)錄因子首先與DNA的TATA盒結(jié)合形成復(fù)合體,然后RNA聚合酶也進(jìn)入啟動(dòng)子的核心區(qū)TATA。在轉(zhuǎn)錄因子的作用下,共同形成轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物并開(kāi)始轉(zhuǎn)錄。翻譯起始密碼子AMC位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)下游。復(fù)制過(guò)程有固定的復(fù)制起始點(diǎn),但其堿基序列可能與TATA序列不同。核糖體在蛋白質(zhì)生物合成時(shí)與mRNA結(jié)合,而增強(qiáng)子是遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、能增強(qiáng)啟動(dòng)子活性的DNA序列。

Pribnow框(Pribnowbox序列)是在原核生物中,位于啟動(dòng)子上游的共有序列,具有解旋功能部位的高度保守性和一致性。該序列對(duì)避免假信號(hào)的出現(xiàn)至關(guān)重要,估計(jì)信號(hào)序列至少需要有12bp。信號(hào)序列不一定是連續(xù)的,因?yàn)榉珠_(kāi)距離本身也是一種信號(hào)。Pribnowbox序列TATAAT與真核細(xì)胞和古生菌中的TATABox功能相似。

在mRNA前體轉(zhuǎn)錄的起始過(guò)程中,先由轉(zhuǎn)錄因子TF2和TATA框結(jié)合形成穩(wěn)定的復(fù)合物,然后按照一定時(shí)空順序與其他轉(zhuǎn)錄因子和RNA聚合酶與DNA結(jié)合形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物開(kāi)始轉(zhuǎn)錄。這一過(guò)程需要各種因子的協(xié)同作用以及精確的時(shí)序控制。

本文詳細(xì)闡述了真核生物啟動(dòng)子中的TATA盒的作用、位置和功能機(jī)制。通過(guò)了解這些關(guān)鍵元件的作用方式和相互關(guān)系,可以更好地理解基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制。也介紹了原核生物中的Pribnow框等其他相關(guān)元件的功能和重要性。